Perencanaan tingkat puskesmas mencakup semua kegiatan yang termasuk dalam upaya kesehatan wajib, upaya kesehatan pengembangan dan upaya kesehatan penunjang. Beragam perencanaan itu disusun oleh puskesmas sebagai rencana tahunan puskesmas, yang dibiayai dari pemerintah daerah, pemerintah pusat serta sumber dana lainnya.
Setelah membuat rencana kegiatan administrasi PusKesMas, biasanya perlu juga memperbaiki daftar inventaris perlengkapan pelayanan. Karena setiap unit ruangan pelayanan memerlukan alat kesehatan, perlengkapan mobiler dan prasarana yang penting lainnya.
Memasuki periode tahun anggaran baru 2011, biasanya semua staf disibukkan kembali dengan penataan laporan administrasi pelayanan puskesmas. Hal tersebut menyangkut penggunaan anggaran dan mencakup pencapaian program, yang dibuat lengkap secara terpadu.
